• Юридический статус. Копетдагский государственный заповедник был создан в 1976 г. Постановлением Совета Министров Туркменистана за № 348 от 19 августа 1976 г. «Об организации Копетдагского государственного заповедника», согласно которому были изъяты земли Копетдагского лесхоза площадью  49.8 тыс га.  и переданы в бессрочное пользование для организации природного заповедника. 
• Этим же Постановлением были открыты два заказника (Гурыховданский, Меана-Чаачинский) и охранная зона. В связи с упорядочением сети заповедников  в Туркменистане и организацией самостоятельного Сюнт-Хасардагского заповедника (до 1978 г. являлся филиалом  Копетдагского заповедника), сфера деятельности Копетдагского заповедника   ограничилась Центральным и Восточным Копетдагом.
• В 1987 г. Решением Исполнительного комитета Ашхабадского областного  совета народных депутатов от 15.01.1987 г.  заповеднику было передано во временное пользование 20 га  (леса 1 группы) сроком на 10 лет  под  организацию  памятника природы Караялчи с целью сохранения и восстановления популяции грецкого ореха с охранной зоной площадью 91.5 га. В настоящее время решением хякимлика  Бахарлыкского этрапа (исполнительный орган власти местного значения) от 28.02. 2003г. срок  действия  Памятника природы Караялчи продлен на 15 лет.
• В 1988 г. Решением Исполнительного комитета Ашхабадского областного  совета народных депутатов от 02.03.1988 г. заповеднику было передано во временное пользование 2000 га земли под  организацию памятника природы «Чарлык» для изучения, сохранения и восстановления естественной фисташковой рощи сроком на 10 лет. В дальнейшем Постановлением хякимлика Ахалского велаята от 25.07.2003 г.  срок действия был продлен на 10 лет.
• Деятельность Копетдагского заповедника с подведомственными ему структурами закреплена в Положении о Копетдагском заповеднике,  утвержденном Министерством охраны природы Туркменистана (02.04.2001 г.). Согласно Положению  Копетдагский государственный заповедник является юридическим лицом  и  имеет статус научно-исследовательского учреждения, основная цель которого сохранение и восстановление экосистем Центрального и Восточного Копетдага с Подгорной равниной.
• За годы существования заповедника изменения границ и его площадей не произошло. 
• История создания.
• Организации Копетдагского государственного заповедника предшествовало проведение  на этой территории первых работ  по посадкам миндаля и фисташки в Центральном Копетдаге в районе Куртусу в 1914 г. (Огиевский, 1931).  Первые лесоустроительные работы  в Центральном Копетдаге относятся к 1927-1932 гг.  К сожалению, материалы лесоустройства тех лет не сохранились.   В период 1941-1945 гг. на этих участках проводилась заготовка мяса джейранов, архаров, козлов, что резко снизило их численность. В 1948 г. на этих территориях был организован Копетдагский лесхоз, который продолжил свою деятельность вплоть до 1963 г. В эти же  годы проводилась промышленная заготовка трагакантов, значительно подорвавшая сырьевую базу. В 1950 г. в целях охраны природных комплексов Центрального Копетдага правительство Туркменистана принимает решение о создании Центрального Копетдагского заповедника, однако в тяжелые послевоенные годы организация заповедника была отложена. В середине 50-60-х гг. в Копетдаге от бесконтрольной охоты продолжает снижаться численность в первую очередь переднеазиатского леопарда, туркменского горного барана и безоарового козла; в результате сильной эрозии почв усиливаются селевые потоки,  которые в отдельные годы достигают столицы. Усиливающийся антропогенный пресс обусловил острую необходимость создания здесь охраняемых  природных территорий. В 1976 г. Правительство Туркменистана принимает решение о создании Копетдагского государственного заповедника.
• Копетдаг является северным крылом Туркмено-Хорасанской горной системы,  характеризуется богатством и уникальностью видового состава.  Он известен как центр формообразования, зона перекрывания ареалов видов различных по происхождению,  экологии и отношению к биогеографическим комплексам.
• Копетдаг относится к Хорасанской подпровинции Армено-Иранской ботанико-географической провинции Переднеазиатской подобласти Ирано-Туранской области Древнего Средиземноморья. 
• Флора Копетдагского заповедника представлена богатством и разнообразием видового состава, который к настоящему времени достаточно хорошо изучен.
• Низшие растения
• Водоросли. Из низших растений хорошо изучена альгофлора водоемов Центрального Копетдага. Видовой состав включает 284 вида 29 разновидностей из 5 отделов, 9 классов 19 порядков, 47 семейств и 72 рода. Наибольшим таксономическим разнообразием отличаются синезеленые водоросли, которые составляют ядро флоры горных водоемов за счет семейств:  Nostocales, Oscillatoriales. Зеленые водоросли представлены семействами  Volvocales, Chlorococcales, Ulotrichales   и др. Заметного развития в водотоках достигают Cladphora glomerata, Ulotrix zonata, Oedogonium bydulatum. Впервые приводятся представители динофитовых водорослей (Dinophita): Cystodinium phaseolus, Ceratium hirundinella и эвгленовые (Euglenophita): Euglena hemichromata, Astasia klebsii, что подтверждает динамику процессов формирования альгофлоры водотоков (Летопись природы заповедника, 1997).
• Грибы. На территории КГЗ обнаружен 131 вид шляпочных грибов, из которых 55 являются специфическими. Большая часть из них (66%) принадлежит группе гумусовых (почвенных) сапрофитов (роды Morchella, Helvella и др.), многие из которых развиваются на открытых пространствах. Вторая по количеству родов (25%) группа ксилофилов, развивается на отмершей древесине, валеже, пнях, гнилушках: Pleurotus ostreatus, Panus tigrinus и др. В заповеднике встречаются и группа копрофильных грибов, растущих на навозе (Coprinus miser, C. niveus, Anellaria semiovata) и др. Плодоношение грибов тесно связано с климатическими особенностями и происходит в весенний и осенний сезоны. Первыми появляются ксилофильные виды: Pleurotus ostreatus, Coprinus micaceus, Galeropsis desertorum и др. К осенним видам относятся: Agaricus radicatus, Coprinus comatus, Lyophyllum fumosum и др., которые образуют плодовые тела в последней декаде сентября и октября. Например, Pleurotus ostreatus может выдержать небольшие заморозки и встречается в Копетдаге даже в зимний период. Во флоре шляпочных грибов встречаются представители разных географических элементов: бореальный, аридный, эвриголарктический, с преобладающими евроазиатскими и евроазиатско-африканским типом ареала. В заповеднике и на прилегающих территориях зарегистрировано 37 видов съедобных шляпочных грибов и 4 ядовитых – Lepiota brunneoincarnata, Agaricus radicatus, A. xanthodermus var.lepiotoides, A. xanthodermus var. macrosquamosus. Два вида съедобных грибов: черный трюфель (Picoa juniperi Vittad. 1831) и коричневый трюфель (Terfezia leonis Tul. 1862) внесены в Красную книгу Туркменистана .
• Лишайники. На территории КГЗ произрастает 381 вид лишайников, относящихся к 60 родам, 24 семействам и 4 порядкам, которые произрастают на деревьях и кустарниках (эпифиты – 146), на почве (эпигеиды) и на скалах (эпилиты). Богатство видового состава лишайников Центрального Копетдага обусловлено разнообразием типов рельефа, экотопов и субстратов. В лихенофлоре Центрального Копетдага содержится 20 эндемичных лишайников, в их числе 4 новых для науки: Lecanora takyroides Dzhur., Blastenia subimmersa Dzhur., Parmelia subexasperata Dzhur., Lecania duschakensis Dzhur., одна вариация – Phyacia biziana var. corrugata Dzhur., и одна форма Blastenia diphyes f. microcarpa Dzhur. Лишайники являются природными индикаторами и могут служить показателем для территории с засушливым климатом. Наибольшее количество видов сконцентрировано в 14 родах, относящихся к 10 семействам. Значительное количество маловидных родов (55) и семейств (14) говорит о молодости лихенофлоры и видообразовании на территории Центрального Копетдага. Пять видов лишайников внесены в Красную книгу Туркменистана: лептогиум Гильденбрандта – Leptogium hildenbrandii (Garov.) Nyl. 1934, аспицилия окснера - Aspicilia oxneriana Blum, 1970 (эндемик); торнабеа блюдценосная – Tornabea scutellifera (With.) J.R.Laundo, 1953 [Tornabenia atlantica (Ach.) Kurok.]; телосхистес ямчатый - Teloshistes lacunosus (Rupr.) Savicz, 1934; телосхистес горный - Teloshistes montanus Barchal. 1963.
• Высшие растения
• Моховидные (Мхи). Богатство адаптивных возможностей и высокая устойчивость к неблагоприятным воздействиям окружающей среды позволяет им произрастать повсеместно в Копетдаге. Систематический состав бриофлоры заповедника насчитывает 115 видов, в их числе 110 видов листостебельных мхов и 5 печоночников, входящих в 23 семейства и 51 род, что составляет 82 % бриофлоры Копетдага (140 видов). Наиболее интересны виды: Pissiolens persicus, Dicranella howei, Tortula fiorii, Trichostomopsis acronis, Welsia trimphans, Entosthodont angustifolius, Bryum gemniparum, Eurynchium speciosum. В Красную книгу Туркменистана внесены 2 вида - трихостомопсис (Trichostomopsis aaronis (Lor.) Agnew et Townsend, 1867); энтостодон Ганделя ( Entosthodon handelii (Schiffn.) Lazar. 1913).
• Папоротниковидные. В Туркменистане на данный момент произрастает 17 видов папоротников, 2 из них встречаются на территории заповедника и внесены в Красную книгу Туркменистана: анограмма тонколистная – Anogramma leptophylla (L.) Link, 1841 и костец волосовидный – Asplenium trichomanes L. 1753 .
• Сосудистые растения Флора Копетдага, сформировавшаяся автохтонно на общей древней средиземноморской основе, имеет связи с флорами Средней Азии, Закавказья, Северного Ирана. Отличительной особенностью самобытной местной флоры Копетдага является высокий эндемизм (до 18 %). Флора высших сосудистых Копетдагского заповедника насчитывает 988 видов, из которых 37 % средиземноморские, 15% ирано-среднеазиатские, 7% южноголарктические (Камелин, 1973).
• Эндемизм. По данным В. Никитина и К. Курбандурдыева (1978), на территории заповедника произрастает 170 эндемичных и редких растений. Отдельные эндемы ограничены в своем распространении одним пунктом и нигде более не встречаются, например: смородина черноцветная (Ribes melanantum), вероника гауданская (Veronica gaudanensis), смолевка чопандагская (Silene czopandagensis), астрагал Скорнякова (Astrsgalus skorniakowii B. Fedtsch.), остролодочник копетдагский (Oxitropis czapandaghi B. Fedtsch.), лен туркменский (Linum turcomanicum) и др. Среди эндемиков много диких сородичей культурных растений: костер (Bromus kopetdagensis), луки (Allium vavilovii), рябина туркестанская (Sorbus turkestanica), груша туркменская (Pyrus turcomanica Maleev,), яблоня Сиверса (Malus sieversii ) и др. В современной флоре Копетдага имеются реликты палеогенового возраста: платан (Platanus orientalis Dode), каркас кавказский (Celtis caucasica Willd), сахарный тростник (Saccharum officinarum L.) и др. Флора Копетдагского заповедника лишена семейственного эндемизма, но имеются монотипные эндемичные роды как птеропирум (Pteropyrum), дилсиохарис (Dielsiocharis), мориера (Moriera), никитиния (Nikitinia) и др.
• Большинство видов флоры Центрального Копетдага (87%) представлены многолетними и однолетними травами, кустарники и полукустарники насчитывают не более 12%,  деревья 1%. Среди деревьев и кустарников 10 доминантных видов участвуют в создании ландшафтных группировок: арча туркменская (Juniperus turcomanica), клен туркменский (Acer turcomanica), каркас кавказский (Celtis caucasica), боярышник туркестанский (Crataegus turkestanica). Среди кустарников  доминируют барбарис туркменский – Berberis turcomanica, вишня мелкоплодная (Cerasus microcarpa), миндаль туркменский (Amygdalus turcomanica). Деревья и кустарники приурочены к ущельям и северным склонам гор, образуя редколесьe. На южных каменистых склонах с примесью горных пород преобладают нагорные ксерофиты – это колючелистники (Acanthophillum), акантолимоны (Acantolimon), эспарцеты (Onobrichis), которые в условиях водного дефицита образуют плоские или полушаровидные подушки.
• На территории заповедника распространены растительные группировки, входящие в состав трех типов растительности, которые фитоценотически и территориально представлены довольно отчетливо и характерны для всего Копетдага. Наиболее выражены следующие типы растительности: степная, нагорноксерофитная, низкотравная (полусаванная).
• Степная растительность. Степная растительность является одним из распространенных типов, ее основу составляют многолетние травянистые растения и полукустарнички. Степи в Копетдаге представлены несколькими формациями, значительно отличающимися по кологии, видовому составу и строению.
• Основными формациями являются ковыльковые, типчаковые, пыяковые, доминантами  которых выступают  ксерофитные, плотнодерновинные злаки. Степная  растительность  имеет  важное  кормовое значение.
• Нагорноксерофитная растительность. Слагается разнообразными формациями, где доминируют  виды из рода Cerсis, Astragalus (Tragacantha), Acanthophyllum, Acantholimon, Amygdalus, Onobrychis, Cousinia, Jurinea и др. Сообщества нагорных ксерофитов приурочены к мелкоземисто-щебнистым и каменисто-щебнистым грунтам с незначительным включением мелкозема, преимущественно в верхней части склонов и их гребней. Растительные ассоциации нагорных ксерофитов отличаются бедностью видового состава (обычно 10-20 видов), большой разреженностью, что зависит, главным образом, от эдафических условий местообитаний.
• Полусаванная низкотравная растительность. Широко распространена на предгорных равнинах и предгорьях заповедной территории. Включает многочисленные однолетники, коротко вегитирующие травы, эфемероиды, многолетники, которые образуют множество растительных группировок. Эфемерово-эфемероидная  растительность полнее всего выражена на высотах 150 – 300 м н. ур. м. Видовой состав ее включает более 100 растений.
• Антропогенный пресс прошлых лет в виде парубок древесно-кустарниковых растений привел к развитию степной растительности, особенно типчаковых и пырейных группировок.
• Из древесных пород основным доминирующим видом является арча туркменская (Juniperus turcomanica B.Fedtsch.). Арчевники – выходцы из тургайской флоры, но в фитоценотическом отношении представляют молодое образование, получившее самостоятельное выражение только в плейстоцене. Арчевники (Juniperus) – исключительно ксерофитны, что обуславливает их высокую устойчивость и жизнеспособность, несмотря на значительную аридизацию климата. Удивительная экологическая пластичность обеспечивает им возможность роста в диапазоне высот 800 – 3000 м над ур. м. практически во всех местах обитания: в расщелинах и выступах скал, на щебнистых и горных породах. На территории заповедника встречается субальпийский разнотравный арчевник (1700-2400 м над ур. м.), в котором растут рябина (Sorbus), жимолость (Lonicera). Высота взрослых экземпляров арчи колеблется от 4 до 20 м, окружность отдельных стволов превышает 3 м, возраст некоторых деревьев более 600 лет. Крона у арчи имеет разнообразную форму: конусовидную, шаровидную, кустарниковидную. На территории заповедника в последние годы отмечается семенное возобновление арчи, высота которых колеблется от 5 до 45 см и выше. Арча туркменская играет главную водоохранную и противоэрозионную роль.
• В Красную книгу Туркменистана и Красный список МСОП внесено 45 видов.
• Фауна КГЗ богата восточно-средиземноморскими и европейско-кавказскими видами, для которых Копетдаг является крайне восточной границей ареала. В Копетдагском заповеднике наряду с типично средиземноморскими горными и полупустынными животными: сцинки (Scincidae), белоголовый сип (Gyps fulvus), индийский дикобраз (Hystrix indica), туркменский горный баран (Ovis vignei), обитают виды характерные для широколиственных лесов - обыкновенный змееяд (Circaetus gallicus), обыкновенная пустельга (Falco tinnunculus), малая лесная мышь (Sylvaemus uralensis) и др., степей -  степная пустельга (Falco naumanni), золотистая щурка (Merops apiaster), жаворонки полевой и хохлатый (Alauda arvensis и Galerida cristata), перевязка (Vormela peregusna) и другие представители западной части Европейско-Сибирской зоогеографической области. Представители гор и полупустынь Передней Азии - стервятник (Neophron percnopterys), клушица (Pyrrhocorax pyrrhocorax), каспийский улар (Tetragallus caspius), медоед (Mellivora capensis) существуют с типично центральноазиатскими видами - джек-вихляй (Chlamidotis undulate), джейран (Gazella subgutturosa), кулан (Equus hemionus). Из тропиков Эфиопской области сюда проникла полосатая гиенa (Hyaena hyaena). Инвентаризация фауны в заповеднике – один из самых длительных и  трудоемких процессов, который продолжается и по настоящее время.
• А) Насекомые и другие важные беспозвоночные
• Видовой состав насекомых немногим превышает 1000 видов. Наиболее полно исследована фауна пауков – 126 видов из 31 семейства, из которых 17 видов приводятся впервые для фауны Туркменистана, 5 видов встречаются только в Центральном Копетдаге: Agelena tadzhika Andr, Pardoza italika, P. luctinosa, Dictena consecuta (O.P.Combr.), Philodromus histrio (Latr). (Кузнецов, Фет, 1986). Один вид внесен в Красную Книгу Туркменистана - белый каракурт (Latrodectus pallidus O.Pickard-Cambridge, 1872 ).
• Пчелиные представлены 72 видами из 7 родов, особенно широко - средиземноморско-среднеазиатские и палеарктические виды. Впервые для Копетдага приводятся 10 видов: Anthıdıum Affıne F.Mor., Megachile dohrandti F. Mor., Proxilocopa hellenica Spin., Anthophora agama Rad., A. olgae Fedt., A. finifima F. Mor., A.uljanini Fedt., A. parientina Mor. Mor., A. fedtschenkoi Rad., Bombus subterraneus L. (Атдаев, 1986). Видовой состав их в нижних склонах гор и предгорьях богаче, чем в высокогорье. Многие из пчелиных обычные опылители, так, например, Andrena flavipes – широкий политроф, подобно медоносной пчеле посещает 74 вида растений из 26 семейств.
• Наибольший интерес представляют чешуекрылые. Так, отряд дневные бабочки (Rhopalocera) представлен 8 семействами, из которых наиболее многочисленны бархатцы или сатиры –Satyridae (26 видoв) и голубянки –Lycaenidae (28 видов). Ночные бабочки (Macroheterocera) представлены 10 семействами. Наибольшим количеством видов отличается семейство пяденицы - Geometridae (86 видов). Видовой состав чешуекрылых заповедной территории насчитывает 446 видов (Дубатолов, 1993).
• На территории заповедника представлена богатая фауна насекомых-фитофагов, особенно представителей семейства энциртид (Encyrtidae), видовой состав которых насчитывает 107 видов, относящихся к 53 родам, что составляет 41,7% (256 видов из 109 родов) фауны Туркменистана (Мярцева, 1984).
• На территории заповедника обитают 3 вида термитов из 4 известных для Туркменистана: Anacanthotermes turcestanicus Jacobson, A. ahngerianus Jacobson и Microcerotermes turkmenicus Luppova ( Какалиев,1996).
• В Красную книгу Туркменистана внесено 19 видов насекомых, обитающих в заповеднике и на прилегающих территориях, из них в Красный список МСОП внесена дыбка степная (Saga pedo (Pallas, 1771). Многие виды являются эндемичными, редкими, малоизученными, исчезающими, реликтовыми (Tomares callimachus Eversmann, 1848 - каллимах, Madais fausta Olivier, 1804 - мадаис розоватая, Catocala lesbia Christoph, 1887-лента орденская лесбия, Argynnis Alexandra Menetries, 1832 - перламутровка Александра, Anthocharis tomyris Christoph, 1884 - белянка Томарис и др.).
• В) Рыбы
• Фауна рыб отличается значительной бедностью. В немногочисленных водотоках Центрального Копетдага обитает 6 видов рыб, относящихся к 2 отрядам и 3 семействам. Это восточная быстрянка (Alburnoides bipunctatus Eichwaldi (Filippi,1863), закаспийская храмуля (Capoeta capoeta ratensis, (Keyserling, 1861), гамбузия (Gambusia holbrooki Girard, 1859), туркменский гребенчатый голец (Schistura cristatus (Berg, 1898), туркменский голец (S. sargadensis turcmenicus (Berg,1933), закаспийская маринка (Schizothorax pelzami Kessler 1870). Два последних вида внесены в Красную книгу Туркменистана (Приложение 2, 3).
• С) Земноводные и пресмыкающиеся
• По земноводным и пресмыкающимся Копетдага имеются наиболее полные эколого-фаунистические сводки. На территории заповедника зарегистрировано 3 вида  земноводных из 5 видов известных на сегодняшний день для Туркменистана: среднеазиатская жаба (Bufo danatensis), зеленая жаба (Bufo viridis) и озерная лягушка (Rana  ridibunda), объединенных в 2 семейства и 1 отряд.
• Пресмыкающиеся представлены большим разнообразием - 38 видов из 13 семейств, относящихся к 3 отрядам, что составляет 46% фауны пресмыкающихся  Туркменистана (82 вида). В их числе имеются эндемичные, редкие, узкоареальные виды, 8 видов внесены в Красную книгу Туркменистана, 2 - в Красный список МСОП (Приложение 3). На территории заповедника находится единственная в Туркменистане, малоизученная популяция Telescopus rhynopoma (Blanford, 1874) - иранской кошачьей змеи, которая представляет бесценное богатство для  сохранения генофонда. Три вида змей являются ядовитыми и представляют реальную опасность для человека - это среднеазиатская кобра, обыкновенный щитомордник и среднеазиатская гюрза (Приложение 2).
•  D) Птицы
• На территории заповедника зарегистрировано 128 видов птиц, объединенных в 35 семейств и 12 отрядов. Наиболее многочисленным является отряд воробьиных – Passeriformes (71 вид из 18 семейств). Вторым по количеству видов является отряд хищных птиц - Falconiformes (21 вид из 2 семейств). Шесть семейств представлены 1 видом: удодовые – Upupidae, зимородковые - Alcedinidae, сизоворонковые- Coraciidae, тиркушковые- Glareolidae и др. На территории заповедника наиболее разнообразен видовой состав гнездящихся птиц, период гнездования которых совпадает с периодом вегетации растений и наибольшей активностью насекомых.
• В зимний период территория Меана-Чаачинского заказника служит местом массовой зимовки серого гуся - Anser anser, здесь проходит осенне-весенний (февраль-март, сентябрь-ноябрь) миграционные пути  серого журавля (Grus grus), численность во время пролета колеблется от 18000 до 25000 особей. Единичные стаи отмечаются и в апреле. В последние годы в районе местечка Дурнали (что означает “журавлиное место”) на зимовку остаются 300-400 особей. Изредко в журавлиных стаях отмечаются единичные особи белого журавля – стерха (Grus leucogeranus)  и журавля-красавки  (Anthropoides vigro).
  Наибольший интерес представляют крупные хищные птицы, такие, как беркут (Aquila chrysaetos), бородач (Gypaetus barbatus),  внесенные в Красную книгу Туркменистана, а черный гриф (Aegypius monachus) внесен и в Красный список МСОП, белоголовый сип (Gyps fulvus) и стервятник (Neophron percnopterus). На выступах скал  на высоте 30-70 м от подножия отмечены своеобразные места  гнездования   черного аиста (Ciconia nigra). В последние годы зарегистрированы случаи зимовки черного аиста на территории заповедника.
• В Красную книгу Туркменистана занесены 22 вида птиц, из которых 8 внесены в Красный список МСОП  и 17 - в списки CITES (Приложение 3).
• Е) Млекопитающие
• Видовой состав млекопитающих заповедника включает 67 видов, объединенных в 20 семейств и 7 отрядов.
• Наименьшим количеством семейств (2) и видов (8) представлен отряд насекомоядных, которые в основном встречаются в нижнем поясе гор, придерживаясь пологих лессовых склонов, влажных ущелий с травянисто-кустарниковой растительностью. Наиболее распространенными видами являются  ушастый и длинноиглый еж (Hemiechinus auritus, H.hypomelas), малая белозубка (Crocidura suaveolens).
• Большой интерес вызывают представители отряда рукокрылых, который объединяет 16 видов в 3 семейства, что составляет 71 % видового состава рукокрылых Туркменистана. В КГЗ практически во всех высотных поясах встречается большой подковонос (Rhinolophus ferrumeguinum), образующий колонии во влажных пещерах, иногда совместно с остроухой ночницей (Miotis blithi). Многие  колонии насчитывают несколько сот особей. Самым массовым колониальным видом является нетопырь-карлик (Pipistrellus pipistrellus), самым редким видом, известным по 7 экземплярам из двух пунктов, - ночница Наттерера (Myotis nattereri), (Бабаев Х., 1973). В Красную Книгу Туркменистана внесено 6 видов рукокрылых, из которых 5 включены также в  Красный список МСОП: малый подковонос (Rhinolophus hipposideros), южный подковонос (Rhinolophus euryale), трехцветная ночница (Myotis emarginatusi) и др.
• Наибольшим разнообразием представлен отряд зайцеобразных,  включающий  8 семейств и 22 вида, из которых 3 вида внесены в Красную книгу Туркменистана. Мышевидная соня (Myomimus personatus) впервые описана для территории Копетдагского заповедника в 1990 г., встречается в широком диапазоне высот от 700 до 2400 м над ур. м. (Курбанов А. и др., 1990).
• Отряд хищных включает  4 семейства и 14 видов, многие из которых до организации заповедника находились на грани исчезновения. Наряду с такими обычными видами, как шакал (Canis aureus), волк (Canis lupus) лисица (Vulpes vulpes), степная кошка (Felis libyca), участились встречи с манулом (Felis manul), полосатой гиеной (Hyaena hyaena), леопардом (Panthera pardus), афганской лисицой (Vulpes cana) – видами, занесенными в Красную книгу Туркменистана. Последние три вида внесены также в Красный список МСОП. Из 5 видов копытных заповедника в Красную книгу Туркменистана и Красный список МСОП  внесены безоаровый козел (Capra aegagrus), туркменский горный баран (Ovis vignei), обитающие в труднодоступных участках среднего и верхнего пояса гор, кулан (Equus hemionus) и джейран (Gazella subgutturosa), населяющие нижнюю часть гор и предгорные равнины. С 1979–1982 гг. сотрудниками заповедника была проведена реакклиматизация кулана на территорию Меана-Чаачинского и Гурыховданского заказников. В результате существующего природоохранного режима здесь сформировались жизнеспособные популяции кулана.

Койтендагский заповедник

Койтендагский (ранее Кугитанский) государственный природный заповедник (создан в 1986 г.) расположен на крайнем юго-востоке Туркменистана, западном макросклоне хребта Койтендага (Кугитангтау) юго-западного окончания Гиссарского хребта Памиро-Алайской горной системы. Общая площадь заповедника 27139 га. В ведении Койтендагского заповедника находятся 4 заказника: Карлюкский (40 тыс. га). Ходжабурджибелендский (17,5 тыс. га); Ходжапильский (31,6 тыс. га) и Ходжакараульский (6 тыс. га). Территория заповедника представлена единым массивом и расположена между 66^о25’ и 66^о35’ с.ш. и 37^о30,5’ и 37^о51’ в.д. Четко обозначена верхняя восточная граница заповедника, которая проходит по гребню основного хребта, совпадая с государственной границей между Туркменистаном и Республикой Узбекистан. Западная граница проходит ниже арчового пояса, северная – между высотными отметками 2098,0 – 3094 м над ур. м. Южной границей является ущелье Кампрек (Дахна).

Карлюкский государственный комплексный заказник расположен в Койтендагском этрапе и включает в себя южный склон Койтендагского хребта и горную часть от реки Кугитангдарья  до р. Амударья. Протяженность территории с севера на юг и с запада на восток составляет по 20 км. Основные координаты: 66^о20’ и 66^о35’ с.ш. и 37^о21’ и 37^о 33’ в.д. На территории заказника расположены Карлюкские пещеры, сероводородный источник Кайнарбаба и рекреационные ущелья южного склона хребта Койтендаг.

Ходжабурджибелендский государственный ландшафтный заказник (65^о57’ и 66^о16’ с. ш. и 38^о02’ и 39^о09’ в.д.) расположен в Койтендагском этрапе. Протяженность территории с севера на юг 13 км, запада на восток – 30 км. Южная граница идет по линии: зимняя кошара – сухое русло р. Акташсай - колодцы Кокмияр и Шоршар – могила Карамулла. Русло р. Дарья (Таркапчигай) выполняет роль восточной границы заказника, северная граница проходит через зимнюю кошару, которая в 5 км севернее хребта Сакыртма. Западная точка границы находится в 5 км западнее г. Ходжатутлы.

Ходжапильский государственный ландшафтно-палеонтологический заказник (66^о25’ и 66^о43’ с. ш. и 37^о 48’ и 38^о 03’ в. д.) расположен в Койтендагском этрапе и включает северную часть хр. Койтендаг, Койтендагское ущелье и северо-восточный горный участок  Говурдагского низкогорья. Территория представлена единым массивом, который по северной и восточной границе совпадает с государственной границей Республики Узбекистан, южная – по границе заповедника и Койтендагского отделения «Гок гушак». Западная граница проходит по асфальтированной дороге от перевала Акдабан до пос. Куйтан, переходя затем на правую сторону р. Кугитангдарья. Протяженность территории с севера на юг составляет 25,5 км, с запада на восток – 21 км. Территория заказника богата такими памятниками природы, как «Плато динозавров», ущелье «Сорок девушек», ущелье с водопадом «Умбар-дере», серия карстовых озер (Кетте-кёл, Хорджун-кёл и Айгыр-кёл), уникальная роща Унаби, многовековые платаны в пос. Койтен и фисташники Карадепе, которые являются памятниками природы мирового, регионального и местного значения.

Ходжакараульский государственный заказник (800-1000 м над ур. м.) расположен в Койтендагском и Чаршангинском этрапе Лебапского велаята в окрестностях пос. Ходжакараул между территорией заповедника в нижней части макросклона хребта Кугитанг и прилегающей к нему подгорной равниной, которая ограничена автомобильной дорогой (Карлюк-Ходжакараул).

Площадь заповедника вместе с заказниками - 122 306 га. Вся система этих охраняемых территорий является смежной Сурхандаринскому заповеднику Республики Узбекистан.

Центральная усадьба и административный офис заповедника находятся в Койтендагском этрапе в окрестностях поселка Базардепе. Ближайший к центральной усадьбе аэропорт расположен в пос. Магданлы на расстоянии 70 км, железнодорожный вокзал –  в г. Атамурат  (бывший Керки) в  200 км.

Юридический адрес: Туркменистан, 746 670, Лебапский велаят, Койтендагский этрап, г. Базардепе,  Койтендагский государственный заповедник.

Заповедник имеет статус юридического лица государственного учреждения – государственный природный заповедник. Находится в ведении Министерства охраны природы (МОП) Туркменистана и территориально подчинен Койтендагскому хякимлику. Создан на основании Постановления Совета Министров Туркменистана № 295 от 11 июля 1986 г., акта №00764 (от 15.12.1987 г.) Исполнительного комитета Чаршангинского районного совета трудящихся на землепользование по Кугитангскому заповеднику.

Карлюкский, Ходжабурджибелендский и Ходжапильский заказники были организованы постановлением Совет Министров Туркменской ССР № 295 от 11 июля 1986 г. В ноябре 1990 г. (Постановление СМ ТССР № 342  от 19.11.90 г.) при сохранении исходной площади заповедника произошло некоторое изменение его границ: изъяты и перепрофилированы 6 тыс. га нижнего и среднего пояса гор в Ходжакараульском заказнике,  к заповеднику присоединен такой же по площади участок с юга в среднем и верхнем поясе гор.

5 августа 1992 г. выходит Постановление Президента Туркменистана «О мерах по сохранению и использованию Карлюкских пещер и других природных памятников животного и растительного мира Кугитанских гор Чаршангинского этрапа Лебапского велаята», направленое на активизацию процесса развития экотуризма в регионе.

Деятельность Койтендагского заповедника регулируется законом «О государственных особо охраняемых природных территориях» (1992), Типовым положением о Койтендагском государственном заповеднике и рядом актов, которые конкретизируют статус и режим заповедника и подведомственных ему ОТ. Цель и задачи  заповедника обеспечены долговременной законодательной защитой, месторасположение соответствует цели создания.

Биоразнообразие Койтендагского заповедника представляют 1164 таксона, из них 982 вида растений и 182 таксона животных.

Флора

Флору  Койтендагского заповедника представляют 982 вида, 430 родов из 86 семейств (пересчет данных по «Определителю растений Туркменистана», Никитин, Гельдиханов, 1988, включая сведения Д. Курбанова (2005) «Новые флористические находки в горах Кугитанга», а также материалы по лукам «Дикорастущие луки Туркменистана»). Согласно макросистеме цветковых растений (Тахтаджян, 1987), в составе изучаемой флоры находим 4 отдела, 2 класса и 10 подклассов. (Приложение 1). Основу флоры заповедника составляют покрытосеменные растения (99,0%), где очень мало её древних представителей: голосеменных, папоротников и хвощеобразных (10 видов из 9 родов). Соотношение двудольных к однодольным составляет 3,6:1. Представители семейств из подкласса Rosidae (249 видов) имеют в своем составе максимальное число родов (83) и концентрацию видов в трех крупнейших семействах: Fabaceae (121), Apiaceae (49) и Rosaceae (25) видов. В подклассе Dilleniidae (61 род, 100 видов) находим высокую концентрацию родов и видов космополитного семейства Brassicaceae (38 родов, 53 вида). В целом, класс двудольных богаче по количеству видов (759), чем однодольные (213 видов). Достаточно обедненным составом представлена группа древнесредиземноморских родов из семейства Araceae, Lemnacea, Typhaceae - древнего подкласса Arecidae. Высокое положение обширного подкласса Liliidae (83 рода, 213 видов) обеспечивается за счет многочисленности видов семейств Poaceae (100 видов), Liliaceae (33) и Alliaceae (32). Самое богатое по количеству видов - семейство Asteraceae (145 таксонов). Заметна концентрация отдельных родов: астрагалы, кузинии и особенно луки. Десять ведущих семейств в сумме составляют 64,8% состава флоры – типичная черта древнесредиземноморской флоры (таблица 1). В родово-видовом спектре койтендагской флоры, ранжированном по количеству содержащихся видов, отмечается  участие сверхполиморфных монстров, как Astragalus (69 видов), Allium (32) и Cousinia (25), которые вместе с 43 полиморфными родами (по 5-12 видов) дали в сумме почти половину таксономического состава.

Велика роль заповедников в сохранении 39 локальных эндемичных видов, 12 (15) субэндемичных гиссаро-койтендагских и более 63 памироалайских видов. Койтендагские и гиссаро-койтендагские эндемичные виды встречаются по всем высотам (особенно много их среди трагакантников): астрагал Боброва (Astragalus bobrovii), а кугитанский (A. kuhitangi), а свинцовый (A.plumbeus), а. Виллиса  (A.willisii), акантолимон Маева (Acantholimon majevianum), цельнолистник Введенского (Haplophyllum vvedenskyi) и др.